공간오믹스 기초 가이드

공간오믹스의 기본 개념부터 실험 설계, 데이터 분석 및 시각화까지 전 과정을 단계적으로 학습하는 강의입니다.

다음과 같은 내용을 배울 수 있습니다.

공간오믹스 개요 및 기술 소개: 공간오믹스의 정의와 등장 배경을 이해하고, imaging 기반 및 NGS 기반 공간오믹스 방법론의 차이와 특징을 살펴봅니다.

2. 공간오믹스 실험 설계: 연구 목적에 따른 공간오믹스 기술 선택과 시료 준비 등 효율적인 실험 설계 방법을 학습합니다.
3. 데이터 포맷 및 공간 분석 개요: 공간오믹스 데이터 포맷 구조를 이해하고 공간 분석의 기본 원리와 주요 분석 알고리즘 개요를 살펴봅니다.
4. 환경 구축 및 데이터 시각화: 공간오믹스 데이터 분석 환경을 구축하고 Napari 기반 시각화와 분석 관심 영역(ROI) 설정 방법을 학습합니다.
5. 데이터 분석 및 알고리즘Ⅰ: 데이터 전처리와 SquidPy 기반 기본 통계 분석, 클러스터링 및 세포 타입 분류 방법을 학습합니다.
6. 데이터 분석 및 알고리즘Ⅱ: Deconvolution 및 Cell Segmentation 분석을 통해 공간오믹스 데이터의 심화 분석과 결과 해석 방법을 이해합니다.

차세대 생명정보 온라인 교육 진행 강사를 소개합니다.

부산대학교 / 박정빈

부산대학교 조교수

• 부산대학교 학사, 서울대학교 석사, 독일 Ruprecht-Karls-Universitaet Heidelberg 박사
• 생명정보학, 공간 / 단일세포체학, 다중체학