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롱리드 시퀀싱 데이터 분석 Ⅰ
롱리드 시퀀싱 기법의 이해
다양한 시퀀싱의 기법에 대해 이해하며, 그 중에서도 롱리드 시퀀싱 기법에 초점을 맞춘 다양한 생물학 연구 방법을 배웁니다.
다음과 같은 내용을 배울 수 있습니다.

롱리드 시퀀싱 개요: 다양한 시퀀싱 기법과 생물학 연구 방법론에 대해 알아보며, 롱리드 시퀀싱과 기존 숏리드 시퀀싱 기법의 차이를 배울 수 있습니다.
유전체 지도 작성 및 추정: 유전체 정보와 유전체 지도의 차이를 이해하고, 완성된 인간 유전체 지도를 알아봅니다.
Repeat/Gene annotation: 완성된 유전체 지도에서 repeat sequence나 유전자 정보를 annotation 할 수 있는 프로그램을 알아봅니다.
Assembly quality 확인: 확보한 assembly quality를 수치로 확인할 수 있는 방법론을 배울 수 있습니다.
SV calling: 숏리드 시퀀싱 기법으로는 다루기 어려웠던 structural variant에 대해서 알아봅니다.
Visualization: Circos plot과 같은 visualization 툴을 알아봅니다.
차세대 생명정보 온라인 교육 진행 강사를 소개합니다.

서울대학교 / 김준
충남대학교 생명정보융합학과 조교수
포항공과대학교 학사, 서울대학교 석·박사(2020)
서울대학교 기초과학연구원 연구원, 한국생명공학연구원 전임연구원
유전학, 유전체학, 염색체 진화
수료기준
| 평가기준 | 진도 | 시험 | 과제 | 토론 | 기타 |
|---|---|---|---|---|---|
| 배점 | 100% | 0% | 0% | 0% | 0% |
| 과락기준 | 80% | 0점 | 0점 | 0점 | 0점 |
※ 수료기준은 각 평가항목의 점수가 과락기준 점수 이상이고 총점이 80점 이상이어야 합니다.
| 차시 | 강의명 |
|---|---|
| 1차시 | 롱리드 시퀀싱 개요 |
| 2차시 | 리눅스 운영체제 |
| 3차시 | 유전체 지도 작성 개괄 |
| 4차시 | 유전체 크기 추정하기 |
| 5차시 | 유전체 지도 작성 실습 |